More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0610 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  99.74 
 
 
390 aa  790    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  95.38 
 
 
390 aa  768    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  84.83 
 
 
390 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  80.72 
 
 
390 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  100 
 
 
390 aa  793    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  84.32 
 
 
390 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  64.23 
 
 
391 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  64.25 
 
 
390 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  47.93 
 
 
392 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  48.07 
 
 
388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  48.07 
 
 
388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  48.35 
 
 
392 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  44.94 
 
 
393 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  44.93 
 
 
391 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  43.56 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  43.57 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  43.85 
 
 
395 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  45.3 
 
 
390 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  45.75 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  44.24 
 
 
392 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  43.98 
 
 
392 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  45.21 
 
 
392 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  43.78 
 
 
390 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  42.19 
 
 
390 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  42.93 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  42.9 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  38.42 
 
 
368 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 
412 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
390 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
395 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  31.12 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 
390 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  31.14 
 
 
402 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  29.74 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 
389 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  29.56 
 
 
406 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  31.56 
 
 
395 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 
410 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
397 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  30.88 
 
 
392 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  30.41 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 
389 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 
401 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
396 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  28.25 
 
 
392 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
395 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
395 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
407 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 
391 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.76 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
413 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
379 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  29.92 
 
 
381 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
419 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
401 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
389 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  27.95 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
384 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
400 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  26.22 
 
 
463 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
470 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.51 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 
379 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
399 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
376 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1336  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  25.13 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1640  putative UreA/short-chain amide ABC transporter  27.78 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000640664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1846  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.83 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3279  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>