More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4401 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 407 aa  838    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  56.99 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  54.5 
 
 		 379 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  49.23 
 
 		 381 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  47.12 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  47.51 
 
 		 389 aa  341  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  43.94 
 
 		 388 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  44.21 
 
 		 389 aa  335  7.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  47.14 
 
 		 379 aa  332  7.000000000000001e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  43.04 
 
 		 388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  45.36 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  47.25 
 
 		 376 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  43.75 
 
 		 389 aa  323  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  43.99 
 
 		 401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  42.37 
 
 		 391 aa  319  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  46.85 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  41.67 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  41.24 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  43.8 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  39.69 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  43.09 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  41.62 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  40.82 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  37.73 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  39.74 
 
 		 390 aa  288  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  41.87 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  42.62 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  35.86 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  34.02 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 395 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  30.58 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  29.89 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 397 aa  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  28.69 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  30.11 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 392 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  31.46 
 
 		 406 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.81 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  29.34 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  29.21 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 395 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.04 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.78 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  27.71 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.63 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4452  putative Leu/Ile/Val/Thr/Ala-binding protein  26.78 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.35 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  25.6 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  27.52 
 
 		 443 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>