More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2846 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 400 aa  812    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  51.25 
 
 		 399 aa  411  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  50.38 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  45.97 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  42.92 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  41.88 
 
 		 426 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  34.7 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  35.51 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  32.69 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  34.68 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  36.64 
 
 		 390 aa  196  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  34.08 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  32.92 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  35.56 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  35.39 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  35.1 
 
 		 402 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  34.35 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  36.22 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  32.56 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  31.35 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  31.55 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  30.97 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  30.53 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  28.84 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 388 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 		 395 aa  142  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 390 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  30.38 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 		 390 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  30.08 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 		 407 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  26.93 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  25.82 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.53 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  25.99 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  27.27 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  25.56 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  26.53 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 		 402 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0667  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component  26.48 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.76 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  31.86 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>