More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4488 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 391 aa  793    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  70.68 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  67.12 
 
 		 390 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  61.35 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  57.61 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  55.31 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  49.74 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  49.6 
 
 		 389 aa  378  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  48.53 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  43.85 
 
 		 389 aa  362  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  45.13 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  47.15 
 
 		 389 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  49.23 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  44.5 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  47.68 
 
 		 379 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  47.12 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  44.68 
 
 		 389 aa  312  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  41.67 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  43.32 
 
 		 379 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  44.66 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  41.64 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  42.67 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  41.26 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  37.11 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  37.21 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  42.32 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  43.6 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  36.15 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  35.38 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  34.77 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 393 aa  190  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 		 390 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  33.08 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 		 395 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  32.95 
 
 		 387 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  32.36 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  31.72 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 		 392 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 		 394 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  31.09 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  31.38 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 		 392 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  31.4 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  30.81 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  30.61 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  29.3 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 		 426 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  29.03 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  29.81 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  30.08 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  30.92 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.01 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>