More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3643 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  89.97 
 
 		 398 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  100 
 
 		 396 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  62.92 
 
 		 389 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  63.82 
 
 		 390 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  63.54 
 
 		 387 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  51.51 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  47.58 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  47.95 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  46.09 
 
 		 388 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  48.9 
 
 		 379 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  46.86 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  44.47 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  46.03 
 
 		 390 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  46.15 
 
 		 389 aa  330  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  44.11 
 
 		 401 aa  328  9e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  43.96 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  47.92 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  45.27 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  46.85 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  44.66 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  45.43 
 
 		 399 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  41.1 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  40.67 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  43.41 
 
 		 390 aa  303  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  42.7 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  42.58 
 
 		 376 aa  292  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  39.74 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  36.92 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  37.26 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  36.58 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  38.02 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  38.02 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  36.66 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  38.32 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  37.31 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  37.24 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  37.54 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  37.72 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  37.28 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  36.68 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  34.7 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  36.23 
 
 		 395 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  34.92 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  33.93 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  36.83 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  34.18 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  32.42 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  34.73 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  33.9 
 
 		 410 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 		 395 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 		 413 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 		 400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  28.99 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 384 aa  126  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.75 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 423 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4821  putative ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  25.39 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  30.26 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7057  Extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.69 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3112  urea ABC transporter, urea binding protein  27.17 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6250  ABC transporter substrate-binding protein  27.5 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  27.19 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.11 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  28.42 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  26.58 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>