More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2772 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
390 aa  792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  77.44 
 
 
390 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  77.05 
 
 
395 aa  589  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  68.85 
 
 
395 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  69.53 
 
 
397 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  68.21 
 
 
390 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  66.24 
 
 
393 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  69.13 
 
 
389 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  71.54 
 
 
406 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  68.41 
 
 
392 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  70.17 
 
 
394 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  68.7 
 
 
387 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  61.92 
 
 
390 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  62.66 
 
 
387 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  60.93 
 
 
402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  60.56 
 
 
402 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  61.5 
 
 
395 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  62.05 
 
 
395 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  56.46 
 
 
395 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  57.02 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  55.56 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  34.71 
 
 
395 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  35.41 
 
 
390 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  36.72 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  33.86 
 
 
412 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  35.66 
 
 
388 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  36.04 
 
 
399 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
388 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  34.37 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  36.64 
 
 
400 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  34.79 
 
 
390 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  36.83 
 
 
396 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  35.42 
 
 
392 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  34.25 
 
 
390 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
401 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  35.83 
 
 
392 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  34.8 
 
 
392 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  33.68 
 
 
391 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
391 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 
414 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
391 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  34.51 
 
 
392 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  32.05 
 
 
390 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
413 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  36.5 
 
 
398 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
388 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  33.97 
 
 
390 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
388 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
389 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
389 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  34.67 
 
 
393 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  33.51 
 
 
392 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  33.6 
 
 
390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  31.04 
 
 
397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  33.33 
 
 
390 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  33.08 
 
 
386 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 
391 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
390 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 
392 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 
390 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  32.25 
 
 
390 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
390 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 
379 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  31.33 
 
 
390 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
401 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
423 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 
391 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 
426 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  31.25 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 
413 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  27.91 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  32.54 
 
 
387 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 
395 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
376 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  30.83 
 
 
399 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
398 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.23 
 
 
399 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  30.35 
 
 
406 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  31.85 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 
425 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 
396 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  29.73 
 
 
398 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  29.11 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  29.36 
 
 
405 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0821  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  29.03 
 
 
405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>