More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0417 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 393 aa  787    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7912  Extracellular ligand-binding receptor  57.46 
 
 		 407 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3910  Extracellular ligand-binding receptor  58 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.420808  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  54.45 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  52.7 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 		 450 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  31.85 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  34.07 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  31.99 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.76 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  31.02 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  31.76 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  31.56 
 
 		 405 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.7 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  31.9 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2416  Extracellular ligand-binding receptor  31.66 
 
 		 397 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2066  Extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.438352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2551  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 		 400 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1986  extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0332  extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0331  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  28.35 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 384 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 395 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  29.39 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 405 aa  93.2  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 		 414 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 445 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 395 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  29.28 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0851  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.532444  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  27.47 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  26.98 
 
 		 390 aa  89.4  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 392 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  26.98 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0563  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  25.96 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  23.12 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  26.7 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1241  Extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>