More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2031 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  99.51 
 
 
405 aa  822    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  96.3 
 
 
405 aa  785    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  97.28 
 
 
405 aa  787    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  97.04 
 
 
405 aa  788    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  96.46 
 
 
395 aa  764    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  97.53 
 
 
405 aa  787    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  100 
 
 
405 aa  825    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  98.02 
 
 
405 aa  810    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  97.28 
 
 
405 aa  788    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  95.06 
 
 
405 aa  796    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  46.42 
 
 
415 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2066  Extracellular ligand-binding receptor  49.47 
 
 
399 aa  354  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.438352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  47.98 
 
 
400 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  47.71 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1986  extracellular ligand-binding receptor  47.99 
 
 
395 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 
394 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2551  extracellular ligand-binding receptor  48.92 
 
 
400 aa  345  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  46.63 
 
 
397 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2416  Extracellular ligand-binding receptor  47.58 
 
 
397 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  46.36 
 
 
393 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0331  extracellular ligand-binding receptor  48.25 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0332  extracellular ligand-binding receptor  47.44 
 
 
399 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  38.77 
 
 
450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  34.73 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  34.24 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3910  Extracellular ligand-binding receptor  35 
 
 
420 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.420808  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7912  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
407 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0417  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
393 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0038  Extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
391 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0144084  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 
390 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
410 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  27.62 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
415 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
390 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.07 
 
 
415 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 
414 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
392 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  29.5 
 
 
392 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  28.57 
 
 
390 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
390 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  28.61 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
390 aa  113  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2173  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  25.64 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.473102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 
392 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 
397 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  30.25 
 
 
392 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4017  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
391 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
415 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
415 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
401 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 
408 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
415 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
389 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  28.65 
 
 
393 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
390 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
395 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  28.47 
 
 
391 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2526  branched chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  28.34 
 
 
471 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.859261  normal  0.847765 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 
412 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  27.25 
 
 
406 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
417 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  23.96 
 
 
389 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
392 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
388 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
388 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.46 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  27.62 
 
 
402 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 
405 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6574  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.29 
 
 
402 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0289492  hitchhiker  0.00954732 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  24.8 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  27.19 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2566  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.2 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  24.41 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  24.41 
 
 
407 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  31.73 
 
 
451 aa  96.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
411 aa  96.3  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  25.51 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  27.2 
 
 
405 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.92 
 
 
401 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>