More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1173 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
408 aa  827    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  38.21 
 
 
441 aa  242  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 
415 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  32.42 
 
 
401 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.5 
 
 
402 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1663  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
398 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.596073  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1235  extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 
445 aa  156  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  30.14 
 
 
395 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1352  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
432 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  31.93 
 
 
417 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4215  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 
402 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
384 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
405 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
411 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
406 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
402 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0563  twin-arginine translocation pathway signal  29.12 
 
 
421 aa  146  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1241  Extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 
406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1976  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
406 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102141  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 
395 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  30.12 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 
470 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  30.43 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
400 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
390 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 
400 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4056  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423392  normal  0.164952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4475  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.37 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00447507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 
397 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  31.4 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0619  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.21 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0665  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.49 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0659  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.21 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0430109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4882  Extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3968  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.92 
 
 
417 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  30.2 
 
 
415 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0757  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.59 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 
410 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1581  Extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 
401 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.54 
 
 
401 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2172  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.59 
 
 
419 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916243  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2293  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.68 
 
 
419 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0292658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
450 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1798  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
411 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3458  Extracellular ligand-binding receptor  28.89 
 
 
401 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4420  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.14 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2279  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.49 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0940101  normal  0.112603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4272  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.76 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.844691  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.25 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5583  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.55 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0074  putative branched chain amino acid periplasmic binding protein of ABC transporter  28.78 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  30.64 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1399  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
416 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861522  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  28.89 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6575  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  30.2 
 
 
402 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0967723  normal  0.0140332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 
415 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1679  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
411 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5728  twin-arginine translocation pathway signal  30.2 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6092  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  30.2 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299527  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0955  transporter signal peptide protein  30.29 
 
 
416 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223807  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  30.29 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2025  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.718345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3263  putative transporter signal peptide protein  28.07 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0920  putative transporter signal peptide protein  27.61 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7682  putative branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.5 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2578  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436298  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1643  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.93 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
382 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1012  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
438 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0303063  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2391  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
411 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0276546  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1374  extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 
393 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.35 
 
 
401 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2255  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.93 
 
 
419 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
384 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 
438 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
382 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
437 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 
382 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4699  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.143461  hitchhiker  0.00661341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3199  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.64 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3622  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1495  Extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1454  putative Leu/Ile/Val-binding precursor signal peptide protein  29 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.689269  hitchhiker  0.00017453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>