More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3698 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  93.24 
 
 
415 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
415 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  68.91 
 
 
419 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  65.19 
 
 
445 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  60.19 
 
 
432 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  55.77 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  53.09 
 
 
413 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  34.94 
 
 
417 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  31.48 
 
 
411 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  36 
 
 
391 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1052  extracellular ligand-binding receptor  33.01 
 
 
417 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2030  LivK, ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  30.98 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.438312  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3460  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.403632  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 
411 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3558  Extracellular ligand-binding receptor  32.25 
 
 
415 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.987899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  32.34 
 
 
415 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1288  extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
415 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1450  Extracellular ligand-binding receptor  31.75 
 
 
415 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  28.26 
 
 
410 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0048  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  30 
 
 
410 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0549  extracellular ligand-binding receptor  32.18 
 
 
413 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4077  extracellular ligand-binding receptor  29.66 
 
 
397 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 
384 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
390 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4452  putative Leu/Ile/Val/Thr/Ala-binding protein  29.65 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3485  Extracellular ligand-binding receptor  28.47 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6461  Extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0008  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
400 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0939525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
402 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  36.48 
 
 
383 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3529  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.042782  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3537  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.58 
 
 
402 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277166  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3369  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3211  Extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2318  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.94 
 
 
403 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1077  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
397 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000554995  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1717  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  27.18 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.23 
 
 
398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1381  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1793  hypothetical protein  27.47 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0894  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.46 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  28.24 
 
 
401 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
396 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0953  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.2 
 
 
401 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3342  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.33 
 
 
402 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3913  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
404 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1283  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.94 
 
 
401 aa  126  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154147  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1402  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid- binding protein  27.2 
 
 
401 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1607  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.11 
 
 
392 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2936  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.04 
 
 
398 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3375  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.04 
 
 
398 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
396 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5823  putative branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  29.15 
 
 
401 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281514  normal  0.102648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0019  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.38 
 
 
404 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5162  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  27.04 
 
 
398 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15516  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2466  Extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 
400 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1803  hypothetical protein  27.03 
 
 
417 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387974  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
398 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0682  putative branched chain amino acid binding protein  26.53 
 
 
395 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.246685  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3120  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  25.63 
 
 
400 aa  123  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347887  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
398 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3756  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.32 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4065  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.78 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0198  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  25.78 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  27.76 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0757  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.25 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3047  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3991  putative amino acid uptake ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.78 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3119  Extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.741733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5573  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.63 
 
 
396 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2811  twin-arginine translocation pathway signal  26.2 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  28.08 
 
 
448 aa  120  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.59 
 
 
399 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56224  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4994  extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.539292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4075  ABC-type transporter, periplasmic component  26.15 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5073  putative substrate-binding protein  32.68 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6729  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1437  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
401 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0103  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.68 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32797  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0514  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.12 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2970  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.68 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0085  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.68 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.782241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3267  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.33 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1282  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0780459  normal  0.651455 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  28.77 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0807  extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3831  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4908  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.67 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
397 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0949  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.79 
 
 
399 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0076  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
399 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0087  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
399 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356646  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3135  twin-arginine translocation pathway signal  26.93 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0672684  normal  0.543619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
410 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
395 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4450  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
401 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3244  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114685  normal  0.545433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>