More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0229 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
441 aa  893    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1173  extracellular ligand-binding receptor  38.21 
 
 
408 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
415 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3427  ABC transporter substrate-binding protein  28.46 
 
 
422 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4420  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.12 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3322  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 
423 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204494  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
401 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0563  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 
421 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0857  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
411 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1352  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4215  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 
402 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.36 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
402 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2428  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic substrate- binding protein  25.63 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.600985  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1235  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
445 aa  111  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0126  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
402 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
406 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1663  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
398 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.596073  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  23.97 
 
 
405 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2341  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
405 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.840598  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 
396 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3411  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  24.36 
 
 
405 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000582907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2425  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
411 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1766  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  23.85 
 
 
405 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  26.72 
 
 
397 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2010  branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein, putative  24.1 
 
 
405 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1931  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  24.36 
 
 
405 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2031  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  24.1 
 
 
405 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0138904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1560  urea ABC transporter, substrate-binding protein  29.3 
 
 
422 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 
412 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
419 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1241  Extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
406 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
419 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
415 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 
390 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
384 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1967  putative branched-chain amino acid ABC transporter, branched chain amino acid-binding protein  23.59 
 
 
405 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000097926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
384 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1792  branched-chain amino acid ABC transporter branched chain amino acid-binding protein  23.33 
 
 
405 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1749  branched-chain amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  23.33 
 
 
405 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
416 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1931  branched chain amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.8 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
377 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  30.27 
 
 
414 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 
444 aa  96.7  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
437 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3968  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.55 
 
 
417 aa  94.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  25.89 
 
 
405 aa  94  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
445 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
410 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
415 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
421 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
395 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
407 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1976  extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 
406 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102141  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  27.78 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
415 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  26.72 
 
 
386 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3805  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
450 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0795418  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.95 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.63 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2556  ABC transporter substrate-binding protein  26.67 
 
 
414 aa  89.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  26.09 
 
 
418 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4279  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6073  Extracellular ligand-binding receptor  27.55 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.84 
 
 
389 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  25.26 
 
 
392 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  27.74 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
414 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
438 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  25.63 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2894  Extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4104  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  26.18 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4204  extracellular ligand-binding receptor  23.88 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4452  putative Leu/Ile/Val/Thr/Ala-binding protein  23.41 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
390 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3212  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.21 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.978444  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1103  urea ABC transporter, urea binding protein  24.03 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1190  putative ABC branched-chain amino transporter, periplasmic binding protein  28.17 
 
 
401 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>