More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4759 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  85.1 
 
 		 421 aa  747    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 421 aa  862    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  85.3 
 
 		 424 aa  721    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  71.53 
 
 		 416 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  70.28 
 
 		 413 aa  591  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  68.17 
 
 		 419 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  64.98 
 
 		 428 aa  564  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  52.24 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  53.56 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.8 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  24.76 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 393 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 		 384 aa  97.1  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  28.44 
 
 		 383 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 384 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  26.64 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.23 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 396 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 384 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 		 394 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 377 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 		 394 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.57 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.25 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.27 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.13 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 384 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 404 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2589  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.282343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  27.59 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1959  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.59 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.59 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.33 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.92 
 
 		 382 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0110  Extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.47 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.2 
 
 		 406 aa  87.4  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.01 
 
 		 371 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.01 
 
 		 371 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  28.41 
 
 		 386 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>