More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0326 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
441 aa  906    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
382 aa  110  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 
398 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
403 aa  106  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.43 
 
 
383 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  23.5 
 
 
394 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
386 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.54 
 
 
396 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
382 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
399 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
383 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 
383 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
418 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
339 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 
387 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
394 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
377 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 
421 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
419 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
376 aa  98.2  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
373 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.97 
 
 
376 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
387 aa  97.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  22.33 
 
 
417 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.22 
 
 
404 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
404 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  22.6 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
384 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
396 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
424 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
415 aa  93.2  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.28 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  22.02 
 
 
421 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 
397 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 
437 aa  91.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  23.92 
 
 
389 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
413 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 
405 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  25.12 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  24.83 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
386 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
386 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  21.95 
 
 
434 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
373 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
444 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  26.46 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.34 
 
 
392 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 
382 aa  87  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 
386 aa  86.7  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  23.26 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3551  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
389 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.4 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.07 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.88 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.88 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
434 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2279  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1352  extracellular ligand-binding receptor  23.79 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2827  extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11004  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  23.23 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  23.81 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4333  Extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  24.07 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0664  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.28 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.73 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>