More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0314 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
397 aa  808    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  48.48 
 
 
394 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  51.29 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  37.79 
 
 
385 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  37.13 
 
 
402 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  36.86 
 
 
383 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  38.73 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  36.59 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.86 
 
 
383 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  37.01 
 
 
381 aa  229  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
417 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.3 
 
 
376 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  32.36 
 
 
376 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
374 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 
406 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.08 
 
 
401 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
417 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 
408 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
453 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 
413 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
418 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
459 aa  146  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 
386 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
434 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.96 
 
 
387 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 
377 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.02 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 
386 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.13 
 
 
403 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
402 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 
376 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.21 
 
 
406 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.21 
 
 
406 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
413 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.34 
 
 
414 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
382 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 
421 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
401 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  28.47 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.39 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
374 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 
404 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  28.64 
 
 
392 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.09 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 
376 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
378 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 
432 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 
378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.53 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1675  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0898959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.64 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  29.94 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 
378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  30.23 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
378 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
378 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  26.6 
 
 
416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
415 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.48 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.8 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
382 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
383 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  26.15 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
392 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
381 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
406 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
414 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
390 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  29.96 
 
 
376 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
375 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
416 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
373 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 
428 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
376 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
381 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 
384 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 
373 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2361  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
383 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00517611  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
371 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>