More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1322 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
418 aa  857    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  67.19 
 
 
412 aa  542  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  51.76 
 
 
416 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  53.56 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  52.24 
 
 
421 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  51.01 
 
 
424 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  50.13 
 
 
428 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  50.4 
 
 
413 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
474 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
444 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.42 
 
 
376 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
394 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 
417 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
373 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 
434 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
376 aa  96.7  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 
381 aa  96.3  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
339 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
397 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
445 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.25 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
384 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
400 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
372 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.13 
 
 
396 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
379 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.16 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.03 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
439 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  25 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4112  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.31 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  25.39 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  23.78 
 
 
384 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  23.92 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.76 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  24.41 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  26.44 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.38 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
395 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  26.3 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  27.11 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1908  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.92 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5759  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  24.31 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>