More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3303 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  83.2 
 
 		 396 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 393 aa  783    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  84.5 
 
 		 396 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  83.84 
 
 		 396 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  74.59 
 
 		 394 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  67.96 
 
 		 395 aa  545  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  65.36 
 
 		 390 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  36.62 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  36.67 
 
 		 397 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  36.39 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 		 404 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  37.1 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  37.3 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  34.35 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  36.04 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  36.44 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.44 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  35.56 
 
 		 412 aa  205  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  36.71 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  35.32 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  35.86 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 		 392 aa  186  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  34.07 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  32.83 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.88 
 
 		 376 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  32.38 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 		 382 aa  142  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 		 394 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3260  hypothetical protein  26.89 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.52 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 		 395 aa  122  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.65 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.84 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3501  extracellular ligand-binding receptor  32.16 
 
 		 448 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.29 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.27 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0192  hypothetical protein  28.65 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.681892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.29 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.52 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.36 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.9 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>