More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A1095 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  99.75 
 
 
406 aa  828    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  100 
 
 
406 aa  828    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  75.07 
 
 
401 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 
413 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 
411 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  35.28 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 
403 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  32.37 
 
 
407 aa  212  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 
453 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
459 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 
414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
470 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  32.4 
 
 
392 aa  168  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.13 
 
 
385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.72 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 
406 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
383 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
397 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 
432 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.9 
 
 
381 aa  123  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
428 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.67 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
408 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.41 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.26 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  28.09 
 
 
382 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
383 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
382 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  27.53 
 
 
662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  27.81 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.81 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.37 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.81 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.81 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.81 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.69 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
381 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
404 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
413 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
404 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.87 
 
 
403 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 
413 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.92 
 
 
378 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 
416 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  28.06 
 
 
373 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  28.13 
 
 
373 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
398 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
339 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
376 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 
416 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
382 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
382 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
382 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.94 
 
 
374 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
374 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
376 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
378 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 
390 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 
383 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
378 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
368 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
461 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
461 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 
416 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
382 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
386 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
371 aa  102  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
377 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
382 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.29 
 
 
432 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5221  Extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
379 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.029602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.77 
 
 
515 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
382 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  26.29 
 
 
405 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1959  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.29 
 
 
405 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
388 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
373 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
389 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  24.38 
 
 
416 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  26.52 
 
 
393 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
388 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.56 
 
 
373 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2810  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 
377 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>