More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0895 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
421 aa  855    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  66.59 
 
 
434 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  66.24 
 
 
417 aa  554  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  31.81 
 
 
407 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  31.87 
 
 
402 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  31.55 
 
 
394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 
415 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  30.27 
 
 
406 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  28.89 
 
 
414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
418 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 
416 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
413 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  27.91 
 
 
416 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.13 
 
 
401 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1904  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
406 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 
414 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 
408 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
416 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.24 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.05 
 
 
383 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.57 
 
 
385 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
459 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  33.46 
 
 
339 aa  122  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.57 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.87 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.87 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
470 aa  113  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2279  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
448 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
376 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
406 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  22.46 
 
 
436 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
411 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  31.8 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  30.04 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0154  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
395 aa  96.3  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3025  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  30.04 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0172  Extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1870  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
358 aa  93.6  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0220738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.67 
 
 
395 aa  93.6  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
373 aa  93.2  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
386 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1241  Extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 
406 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 
381 aa  93.2  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.78 
 
 
378 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 
415 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
379 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 
382 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1801  extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
405 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.3 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
379 aa  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4064  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00184477  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  27.56 
 
 
371 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
390 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  24.45 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 
372 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
383 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
379 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
380 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
398 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.74 
 
 
381 aa  87  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  31.2 
 
 
384 aa  86.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.65 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.39 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1976  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102141  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.5 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  28.73 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
372 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.47 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>