More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1502 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
418 aa  851    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  71.77 
 
 
416 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  71.77 
 
 
416 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  68.27 
 
 
416 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  68.03 
 
 
416 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  67.79 
 
 
415 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  70.91 
 
 
414 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  70.39 
 
 
414 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 
436 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 
417 aa  192  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 
408 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2279  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 
434 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2827  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
458 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11004  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.28 
 
 
387 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
421 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.46 
 
 
403 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  26.97 
 
 
407 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.48 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 
406 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.26 
 
 
383 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
383 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1904  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.46 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.32 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
397 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 
439 aa  110  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.44 
 
 
396 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
407 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 
381 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
339 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 
403 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
394 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
401 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.83 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.08 
 
 
406 aa  99  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 
395 aa  92.8  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  24.61 
 
 
406 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  22.84 
 
 
413 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2494  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  24.51 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.81 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  28.52 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
378 aa  87  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  23.21 
 
 
453 aa  86.3  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  28.63 
 
 
470 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  23.51 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  22.28 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  22.92 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  25.17 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.38 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  23.92 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.71 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2706  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  22.89 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.28 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  26.5 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>