More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0641 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
418 aa  858    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  34.5 
 
 
434 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 
417 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  28.08 
 
 
416 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 
416 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.25 
 
 
414 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
415 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
414 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 
400 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.96 
 
 
401 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  28.65 
 
 
407 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 
406 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
416 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1904  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
402 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 
416 aa  136  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.12 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
394 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.3 
 
 
376 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
418 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.38 
 
 
403 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
408 aa  123  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.87 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.87 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
339 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.47 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.13 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  28.2 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
383 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2827  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 
458 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11004  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
441 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  23.33 
 
 
409 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
381 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.87 
 
 
467 aa  99.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.43 
 
 
381 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2279  extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
406 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
461 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
384 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
453 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  23.06 
 
 
382 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  22.93 
 
 
662 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  22.5 
 
 
470 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  22.78 
 
 
382 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.9 
 
 
515 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  23.2 
 
 
382 aa  92.8  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.9 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  23.02 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.93 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
395 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.93 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.93 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.93 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 
382 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  22.93 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  25.41 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.61 
 
 
404 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
373 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  21.97 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.41 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
404 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 
396 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 
382 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  22.53 
 
 
389 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  23.29 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
381 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
381 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
373 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
373 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 
390 aa  87  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  21.43 
 
 
388 aa  87  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.19 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
382 aa  86.3  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>