More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0853 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  100 
 
 
381 aa  779    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  85.04 
 
 
381 aa  672    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  65.09 
 
 
385 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  58.61 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  58.61 
 
 
383 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  58.89 
 
 
383 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  58.33 
 
 
383 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  38.73 
 
 
397 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  35.83 
 
 
394 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  33.97 
 
 
339 aa  155  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
374 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
407 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3084  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0552294  normal  0.474312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.18 
 
 
387 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
398 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 
393 aa  127  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 
376 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.88 
 
 
383 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 
382 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
382 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
383 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 
401 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.63 
 
 
399 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 
383 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  28.64 
 
 
403 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
401 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
381 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.9 
 
 
406 aa  123  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.29 
 
 
402 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 
401 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.63 
 
 
406 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.57 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.75 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.75 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.75 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.75 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.75 
 
 
380 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  28.75 
 
 
380 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 
417 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.75 
 
 
380 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.66 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.48 
 
 
414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.13 
 
 
380 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 
371 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
399 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  29.18 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.13 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.4 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3346  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.27 
 
 
380 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
388 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.27 
 
 
380 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.27 
 
 
380 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  29.27 
 
 
372 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.27 
 
 
380 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
408 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  29.27 
 
 
380 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
381 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 
380 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  30.06 
 
 
375 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  26.79 
 
 
416 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
382 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
386 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
399 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
402 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1618  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.64009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
373 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.92 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 
460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 
376 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 
375 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
373 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 
393 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
373 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>