More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0549 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  96.53 
 
 
459 aa  805    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
453 aa  918    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  83.46 
 
 
470 aa  713    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  88.01 
 
 
392 aa  722    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  32.59 
 
 
413 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  35.18 
 
 
407 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  33.75 
 
 
406 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  34.04 
 
 
406 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.04 
 
 
406 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
411 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
401 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 
403 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
394 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
434 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
417 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.58 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 
421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 
406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.63 
 
 
383 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  28.99 
 
 
407 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.62 
 
 
381 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
381 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
414 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
368 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
376 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  25.6 
 
 
416 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
439 aa  106  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 
416 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  30.74 
 
 
339 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
415 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.62 
 
 
382 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2205  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
418 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 
408 aa  96.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 
432 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.9 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
424 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
418 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
417 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0765  hypothetical protein  28.57 
 
 
445 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0404375 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.23 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
436 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.64 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
413 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
382 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.23 
 
 
401 aa  90.9  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
421 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
390 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 
373 aa  90.1  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
428 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
417 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  24.01 
 
 
407 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.63 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 
416 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
378 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
373 aa  87.8  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
378 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
371 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.8 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  24.39 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.47 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  24.39 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3966  hypothetical protein  26.08 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0643  Extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.09 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 
418 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  25.33 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>