More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2424 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
383 aa  776    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  87.16 
 
 
402 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  98.43 
 
 
383 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  98.69 
 
 
383 aa  769    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  69.09 
 
 
385 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  57.64 
 
 
381 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  57.48 
 
 
381 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  36.34 
 
 
397 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  37.6 
 
 
394 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  35.94 
 
 
339 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
413 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
415 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
393 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 
407 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
434 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.59 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.88 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.99 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.99 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.39 
 
 
376 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
381 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 
380 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
402 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  29.39 
 
 
380 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 
380 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 
380 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
376 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.43 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
375 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.32 
 
 
380 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.15 
 
 
402 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  28.71 
 
 
421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
383 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.97 
 
 
373 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.55 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.77 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
380 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 
374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  30.14 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
382 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.95 
 
 
380 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3159  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
376 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
376 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
380 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
398 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
384 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
377 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
386 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  31.14 
 
 
376 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
459 aa  124  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 
376 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
375 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
384 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
375 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 
386 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 
382 aa  123  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  29.01 
 
 
392 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
406 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
399 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
380 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 
384 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
375 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
414 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 
384 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.79 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>