More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1098 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
416 aa  849    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  90.62 
 
 
416 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  74.1 
 
 
418 aa  594  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  67.31 
 
 
416 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  66.34 
 
 
416 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  66.91 
 
 
415 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  69.69 
 
 
414 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  66.99 
 
 
414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 
436 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
417 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 
408 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2279  extracellular ligand-binding receptor  30.13 
 
 
448 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  31.8 
 
 
406 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2827  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
458 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11004  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.45 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 
418 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.99 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  28.16 
 
 
407 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.05 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
413 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.12 
 
 
401 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 
434 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
406 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
402 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
397 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.45 
 
 
383 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
383 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1904  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 
403 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 
407 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
439 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 
381 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.06 
 
 
406 aa  106  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
394 aa  106  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.34 
 
 
406 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
411 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.48 
 
 
381 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.89 
 
 
376 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
339 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 
470 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
374 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  22.64 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.19 
 
 
396 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 
453 aa  89  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 
376 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.71 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.83 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 
382 aa  84  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  23.34 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  22.33 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  27.18 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.43 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1728  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  24.02 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  22.41 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  24.14 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0643  Extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2330  Extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  25.92 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1940  putative secreted substrate binding protein  26.58 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15659  normal  0.0532415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1136  twin-arginine translocation pathway signal  23.29 
 
 
414 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.206863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2119  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00221988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  25.34 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.432032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>