More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1524 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  92.54 
 
 
453 aa  805    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  85.4 
 
 
470 aa  724    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  89.8 
 
 
392 aa  731    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
459 aa  932    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 
407 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  33.92 
 
 
406 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 
403 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.42 
 
 
406 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  33.42 
 
 
406 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  32.56 
 
 
411 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
394 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
402 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 
434 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.94 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 
417 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
421 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
383 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.48 
 
 
383 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 
402 aa  123  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
383 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.82 
 
 
381 aa  111  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  28.5 
 
 
407 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 
414 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
439 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
381 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
376 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1746  extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 
368 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681098  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
382 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  25.62 
 
 
416 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 
339 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  24.88 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
386 aa  97.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
424 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  24.88 
 
 
415 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 
374 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.4 
 
 
428 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
408 aa  94.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2205  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
418 aa  93.6  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 
421 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  24.01 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.55 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 
382 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  21.97 
 
 
418 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.51 
 
 
401 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0765  hypothetical protein  27.89 
 
 
445 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0404375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
412 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  23.6 
 
 
436 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 
413 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 
373 aa  87  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  26.64 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 
371 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  24.75 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.24 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.38 
 
 
414 aa  84  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
390 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
421 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  25.53 
 
 
373 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  24.08 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0029  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  25.53 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2357  extracellular ligand-binding receptor  29.49 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0768636  normal  0.579443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4065  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  28.51 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  25.5 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  25.76 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.9 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.55 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  25.33 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  22.67 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>