More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0064 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 421 aa  868    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  72.64 
 
 		 416 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  89.52 
 
 		 424 aa  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  88.86 
 
 		 421 aa  736    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  67.78 
 
 		 413 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  66.01 
 
 		 419 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  64.15 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  51.98 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  52.24 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.86 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  27.65 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  23.9 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.97 
 
 		 396 aa  97.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  28.82 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  26.13 
 
 		 390 aa  96.3  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  26.08 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.24 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 		 419 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.54 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  22.02 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.34 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.34 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  27.29 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 		 387 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1977  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.41 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2121  outative extracellular ligand binding protein  27.41 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.96 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4422  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.32 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1959  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.41 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  22.63 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 381 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.11 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.76 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  29.64 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.11 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.76 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.76 
 
 		 380 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>