More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4762 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  88.08 
 
 		 421 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 424 aa  870    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  89.52 
 
 		 421 aa  778    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  70.74 
 
 		 416 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  70.91 
 
 		 413 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  67.24 
 
 		 419 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  62.94 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  52.77 
 
 		 412 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  52.24 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 		 461 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 398 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.68 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  27.54 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.74 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  24.05 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 		 377 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 386 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  23.47 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.88 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.88 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.79 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 391 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 384 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  30.38 
 
 		 389 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.86 
 
 		 402 aa  93.2  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.84 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  23.66 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.96 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.96 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.96 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  22.78 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0360  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.87 
 
 		 384 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2589  extracellular ligand-binding receptor  25.31 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.282343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2023  Extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.3 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>