More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1254 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1254  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
474 aa  965    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3307  Extracellular ligand-binding receptor  51.22 
 
 
461 aa  438  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3808  Extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 
434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1321  Extracellular ligand-binding receptor  31.45 
 
 
444 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  29.4 
 
 
413 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
418 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
416 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
419 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
412 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 
421 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
424 aa  143  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.95 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  21.09 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.6 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.71 
 
 
1118 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.93 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  23.63 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.96 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.79 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1749  ABC transporter substrate-binding protein  26.07 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239653  normal  0.31899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1511  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565949  normal  0.673528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  22.36 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  22.74 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.55 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.55 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  21.34 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  25.22 
 
 
401 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  22.57 
 
 
415 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2316  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
437 aa  67  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  24.88 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  23.43 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0152  twin-arginine translocation pathway signal  24.87 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1404  branched-chain amino acid ABC transporter  25.65 
 
 
451 aa  64.7  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.977917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3718  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  24.59 
 
 
450 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.203284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 
397 aa  64.7  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.78 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.03 
 
 
403 aa  63.2  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  21.34 
 
 
382 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  22.25 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  22.91 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  20.68 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  22.67 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5695  Extracellular ligand-binding receptor  21.91 
 
 
382 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0211011  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2993  hypothetical protein  24.5 
 
 
386 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.96 
 
 
399 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
419 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0052  Extracellular ligand-binding receptor  22.29 
 
 
387 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3830  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  23.95 
 
 
450 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  21.97 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
404 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
406 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  21.74 
 
 
373 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.85 
 
 
380 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 
434 aa  59.7  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6648  Extracellular ligand-binding receptor  21.91 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0122953  normal  0.152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3135  twin-arginine translocation pathway signal  24.03 
 
 
450 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0672684  normal  0.543619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  22.97 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  24.58 
 
 
389 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  21.53 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2759  twin-arginine translocation pathway signal  23.76 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1944  twin-arginine translocation pathway signal  23.76 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  20.88 
 
 
382 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  21.39 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  20.25 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  22.01 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3292  hypothetical protein  25.15 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.406168  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 
375 aa  57.4  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2864  putative periplasmic binding ABC transporter protein  25.33 
 
 
401 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
396 aa  57  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3297  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.04 
 
 
400 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.300791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  22.31 
 
 
380 aa  56.6  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 
396 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3673  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  22.22 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0513677  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  22.34 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
384 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1381  twin-arginine translocation pathway signal  21.64 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  21.85 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4029  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.04 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  23.26 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0182  Extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  22.57 
 
 
379 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>