More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2423 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
410 aa  809    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  29.93 
 
 
404 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 
397 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  28.84 
 
 
421 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 
440 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 
422 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
424 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
441 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
426 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
415 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
440 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
440 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  26.56 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  28.02 
 
 
415 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
376 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
442 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  24.13 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  28.15 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.81 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  24.3 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 
439 aa  84  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
373 aa  84  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
424 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  24.34 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  32.58 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.33 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  23.74 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.63 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  25.79 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  25.16 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.12 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  31.18 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  29.32 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 
445 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  25.28 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  28.8 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.05 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  29.1 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  31.67 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  32.38 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  31.67 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  31.67 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  27.8 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.38 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.38 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.43 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  23.76 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.81 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.81 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  30.81 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  30.81 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  23.84 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.81 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.81 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  31.11 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  24.21 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  29.81 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
394 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>