More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1378 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 439 aa  884    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  69.33 
 
 		 441 aa  513  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  64.89 
 
 		 440 aa  505  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  62.4 
 
 		 440 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  61.89 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  63.59 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  48.17 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  36.41 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  34.95 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  33.76 
 
 		 449 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  31.78 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 		 422 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 442 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  32.75 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  30.16 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 394 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.43 
 
 		 394 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  34.39 
 
 		 422 aa  134  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 401 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  32.04 
 
 		 426 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  28.17 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 439 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 		 375 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.34 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 		 375 aa  103  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.18 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 		 404 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.16 
 
 		 404 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  34.26 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.92 
 
 		 419 aa  93.6  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 366 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 366 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 		 396 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 366 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.82 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 		 384 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  30.22 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 384 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.82 
 
 		 444 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 427 aa  89.7  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  30.57 
 
 		 384 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 381 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.3 
 
 		 378 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 375 aa  89  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.8 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 		 381 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.1 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.21 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 		 375 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 374 aa  87.4  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.39 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.39 
 
 		 376 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.62 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.62 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.62 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>