More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1154 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  91.62 
 
 		 424 aa  712    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 449 aa  894    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  48.31 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  46.21 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  45.71 
 
 		 422 aa  294  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  46.32 
 
 		 439 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  40.4 
 
 		 426 aa  286  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  43.75 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  38.19 
 
 		 414 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  47.76 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  35.11 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  36.29 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  32.28 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  33.59 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  35.48 
 
 		 394 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  35.19 
 
 		 394 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.19 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  30.74 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  30.74 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 		 399 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.91 
 
 		 449 aa  133  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  37.78 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  32.75 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 440 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  32.83 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  33.07 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 		 401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.56 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.22 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  29.76 
 
 		 384 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 		 401 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 380 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.93 
 
 		 380 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.93 
 
 		 380 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.93 
 
 		 380 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.93 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  28.88 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.93 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.93 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.93 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.88 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  28.88 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.88 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.88 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.88 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.12 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.66 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 381 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  28.8 
 
 		 420 aa  103  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  28.54 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.75 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  34.51 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 		 399 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 		 371 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.26 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.56 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  34.15 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  26.75 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.66 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 		 399 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.279691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>