More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0893 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
423 aa  818    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  63.16 
 
 
437 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 
424 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  34.74 
 
 
426 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  35.13 
 
 
426 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  33.01 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  31.9 
 
 
415 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 
412 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 
422 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  29.98 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 
442 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  28.93 
 
 
741 aa  89.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
441 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  26.89 
 
 
421 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.05 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.29 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  33.74 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  33.74 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.64 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.03 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1559  Extracellular ligand-binding receptor  32.39 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  31.63 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.49 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  31.63 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  30.8 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  34 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  35.29 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  31.12 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.6 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
373 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.83 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.44 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.98 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
372 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  28.29 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  26.54 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.35 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.54 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  26.54 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  23.91 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  33.94 
 
 
373 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.84 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
384 aa  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  33.94 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  31.31 
 
 
416 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3766  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic leucine-specific-binding protein LivK  24.73 
 
 
369 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
373 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
373 aa  63.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>