More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3017 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 426 aa  845    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  49.48 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  50.67 
 
 		 449 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  44.84 
 
 		 412 aa  307  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  43.03 
 
 		 414 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  43.32 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  43.66 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  42.17 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  41.25 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 		 415 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  50 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  34.47 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  32.22 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  32.26 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  46.22 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  41.7 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  32.88 
 
 		 440 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  32.32 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  31.12 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.61 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  34.95 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.84 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  31.61 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.58 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.81 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  33.73 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.76 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 388 aa  96.7  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.99 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  28.24 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.24 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  28.24 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.24 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  34.16 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.24 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.24 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  29.2 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.84 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.33 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 384 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  25.86 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  33.49 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  34.48 
 
 		 384 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 375 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  32.84 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  32.85 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  35.33 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  29.77 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  34.12 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>