250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1736 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  100 
 
 
425 aa  843    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  78.59 
 
 
425 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2091  branched-chain/neutral amino acids amide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  48.83 
 
 
365 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649007  normal  0.0283766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  45.36 
 
 
422 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  42.05 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.52 
 
 
446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 
404 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  35.15 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  32.82 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 
449 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  36.41 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  39.51 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  32.64 
 
 
442 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.97 
 
 
449 aa  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 
440 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 
440 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  33.33 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.75 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  31.38 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  32.29 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  36.65 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  30.37 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  31.79 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  31.66 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  31.77 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.77 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  37.6 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  31.98 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  35.15 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  34.32 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  30.89 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
393 aa  63.9  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  26.54 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  33.81 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.93 
 
 
402 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
381 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.79 
 
 
388 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 
381 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  29.5 
 
 
451 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.54 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
386 aa  56.6  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
373 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
824 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  28.39 
 
 
377 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  23.7 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.07 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.82 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  23.73 
 
 
372 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.82 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.82 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.73 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  32.14 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  26.82 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.16 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.82 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
386 aa  53.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.82 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.92 
 
 
373 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  29.3 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.35 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.35 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.35 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>