192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3090 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
425 aa  835    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  78.59 
 
 
425 aa  629  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2091  branched-chain/neutral amino acids amide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  48.64 
 
 
365 aa  252  8.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649007  normal  0.0283766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  44.57 
 
 
422 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  40.83 
 
 
424 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.15 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  34.87 
 
 
404 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  34.16 
 
 
421 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  34.45 
 
 
426 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 
442 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  32.46 
 
 
440 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  31.84 
 
 
424 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  40.13 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  30.96 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  35.16 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  33.86 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  31.05 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  36.18 
 
 
414 aa  84  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.67 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  36.73 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  38.46 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  33.16 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.05 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  32.04 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  33.69 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.4 
 
 
449 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
399 aa  77  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  40.16 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  32.95 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  36.57 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  40.35 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  40.35 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  45.65 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  35.37 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 
442 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
389 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
386 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  26.79 
 
 
371 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
427 aa  56.6  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  35.2 
 
 
394 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  32.64 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4969  extracellular ligand-binding receptor  34.04 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.935688  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  33.09 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  24.68 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 
401 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 
401 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4947  extracellular ligand-binding receptor  24.58 
 
 
372 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 
385 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.33 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 
824 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  24.2 
 
 
375 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.33 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
373 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 
386 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3623  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.606149  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3348  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5019  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5268  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0651  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.02 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.837637  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.92 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.78 
 
 
402 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4432  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197262  hitchhiker  0.000137112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
752 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 
405 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 
375 aa  50.4  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
814 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>