More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0661 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
439 aa  877    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  50.26 
 
 
425 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  46.61 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  35.53 
 
 
404 aa  179  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  34.11 
 
 
414 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 
424 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 
433 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 
401 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
440 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
440 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  29.43 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  29.58 
 
 
395 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 
399 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 
412 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  29.13 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 
422 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
424 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 
440 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
420 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
399 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
415 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
426 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 
394 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.54 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 
394 aa  93.2  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  26.82 
 
 
409 aa  93.2  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
439 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  27.89 
 
 
368 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 
425 aa  88.2  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  27.64 
 
 
368 aa  87  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.6 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  27.75 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  31.66 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  25.13 
 
 
741 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.89 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2091  branched-chain/neutral amino acids amide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  29.63 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649007  normal  0.0283766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  24.37 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 
367 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  23.85 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
442 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
368 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  24.25 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  21.97 
 
 
401 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  26.82 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  26.88 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0074  ABC branched-chain amino acid transporter substrate-binding protein  27.69 
 
 
394 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  23.46 
 
 
826 aa  63.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  24.43 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 
824 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.04 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  21.74 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
373 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
451 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.94 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3836  extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
410 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.335848  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  23.93 
 
 
393 aa  61.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0313  Extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 
497 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
401 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 
386 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 
386 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
384 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
384 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.76 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  23.85 
 
 
370 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.13 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>