More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0868 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 433 aa  872    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  76.38 
 
 		 440 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  76.38 
 
 		 440 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  61.29 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  60.87 
 
 		 440 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  63.59 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  44.58 
 
 		 421 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  36.41 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  36.57 
 
 		 394 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.32 
 
 		 394 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  33.75 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 		 397 aa  162  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 		 415 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 		 422 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  30.31 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  32.74 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  28.98 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.6 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  31.73 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  30.16 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  32.66 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  28.97 
 
 		 415 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 418 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  31.17 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  26.38 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  31.12 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  32.33 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  27.58 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  31.63 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 370 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 		 373 aa  110  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  33.48 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.21 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.94 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.07 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 386 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  32.89 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 		 375 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 		 377 aa  96.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.18 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.18 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.18 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  26.6 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.18 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  26.48 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  27.18 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.18 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.18 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  27.12 
 
 		 380 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 		 398 aa  94  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  28.48 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.91 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.1 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  24.72 
 
 		 741 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 373 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>