More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3970 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
425 aa  849    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  49.26 
 
 
439 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  48.85 
 
 
442 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  35.32 
 
 
404 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 
433 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  31.21 
 
 
440 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  30.98 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  30.73 
 
 
421 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  34.25 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  34.41 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 
424 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 
415 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
426 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.61 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  29.49 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  29.73 
 
 
401 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 
439 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  31.7 
 
 
439 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 
422 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  28.89 
 
 
424 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
426 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  30.62 
 
 
394 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
394 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.38 
 
 
394 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  29.48 
 
 
395 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  27.97 
 
 
412 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  26.89 
 
 
442 aa  97.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
398 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
386 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
376 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  28.45 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.22 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.39 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
425 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
396 aa  77  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.47 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
370 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.99 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  25.78 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  26.14 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.79 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  29.6 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  25.79 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.41 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  27.61 
 
 
741 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2091  branched-chain/neutral amino acids amide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  29.8 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649007  normal  0.0283766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  26.45 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.88 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1424  Extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 
517 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  27.23 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.83 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  28.75 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  28.75 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>