More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4793 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
441 aa  874    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  76.42 
 
 
440 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  61.1 
 
 
440 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  60.64 
 
 
440 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  61.29 
 
 
433 aa  504  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  69.33 
 
 
439 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  49.48 
 
 
421 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  37.8 
 
 
404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  31.66 
 
 
418 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  31.31 
 
 
397 aa  162  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  33.86 
 
 
394 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 
405 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
394 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  33.42 
 
 
394 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  30.12 
 
 
422 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  31.17 
 
 
414 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  34.91 
 
 
425 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  31.17 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
442 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 
439 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 
405 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  31.76 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  28.87 
 
 
420 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
415 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
426 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 
409 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  29.79 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  29.85 
 
 
424 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  31.03 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
422 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.41 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  27.8 
 
 
412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  28.04 
 
 
442 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  31.06 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 
384 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 
402 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
447 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 
398 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 
439 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 
387 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 
376 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.95 
 
 
393 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
386 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
386 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
380 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
380 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
380 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  29.95 
 
 
372 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.22 
 
 
376 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  29.95 
 
 
380 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
380 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
425 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 
381 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 
373 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
405 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
369 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
426 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
450 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
376 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.6 
 
 
397 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.95 
 
 
378 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
397 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
397 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
370 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 
377 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 
375 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 
372 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  29.65 
 
 
395 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  31.76 
 
 
373 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
451 aa  100  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 
397 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 
375 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 
401 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
381 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 
374 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.72 
 
 
376 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  30.71 
 
 
380 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.72 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.73 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.21 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.72 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  28.72 
 
 
380 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.72 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.72 
 
 
380 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.72 
 
 
380 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 
382 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
376 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  29.07 
 
 
384 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>