More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1418 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
404 aa  805    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  39.1 
 
 
395 aa  264  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  38.78 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  41.4 
 
 
394 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  39.5 
 
 
401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  39.9 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.9 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  38.71 
 
 
394 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  35.84 
 
 
421 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  37.77 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  37.53 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  35.11 
 
 
420 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  36.34 
 
 
399 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  35.22 
 
 
442 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  38.27 
 
 
441 aa  203  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  37.72 
 
 
440 aa  193  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  36.15 
 
 
433 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  35.53 
 
 
439 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  35.82 
 
 
440 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 
424 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
440 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  36.41 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
442 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  36.29 
 
 
449 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  35.32 
 
 
425 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  30.2 
 
 
397 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  31.89 
 
 
405 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  32.99 
 
 
409 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  33.96 
 
 
415 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 
424 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 
384 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.89 
 
 
374 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  32.6 
 
 
414 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  29.93 
 
 
410 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.33 
 
 
396 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 
412 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  29.59 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 
426 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 
422 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  31.19 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.16 
 
 
376 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 
398 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  28.87 
 
 
439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 
382 aa  130  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 
378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  29.82 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
376 aa  126  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 
399 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
404 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  28.84 
 
 
370 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 
404 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  37.79 
 
 
446 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
402 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.6 
 
 
376 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.53 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  32.72 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  29.56 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
370 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
366 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
366 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 
376 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  31.33 
 
 
374 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  28.96 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  31.08 
 
 
386 aa  119  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  29.6 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  31.31 
 
 
400 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 
376 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1775  extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  30.06 
 
 
389 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
372 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 
371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>