More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3964 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  91.36 
 
 		 405 aa  762    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 405 aa  814    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  62.81 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  52.63 
 
 		 409 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  31.89 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  31.54 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  30.12 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 		 440 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.19 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  30.38 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 		 374 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  30.84 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.53 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  26.36 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.16 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  28.71 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  32.6 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.66 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  28.19 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.2 
 
 		 391 aa  97.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 397 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 397 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  27.1 
 
 		 381 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  27.24 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.53 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 382 aa  94.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.6 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6643  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6241  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6410  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  32.53 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.87 
 
 		 378 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  30.14 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 		 814 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 379 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 384 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 378 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  28.39 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3392  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  25.57 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  28.66 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.93 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.41 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  29.03 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.38 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 373 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 		 382 aa  90.1  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  27.03 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.55 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3656  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197403  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>