More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3656 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3656  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 393 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197403  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3976  branched-chain amino acid ABC transporter  88.3 
 
 		 390 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  decreased coverage  0.0022891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0264  extracellular ligand-binding receptor  62.82 
 
 		 391 aa  458  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5971  Extracellular ligand-binding receptor  57.4 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2504  Extracellular ligand-binding receptor  52.68 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2165  extracellular ligand-binding receptor  49.33 
 
 		 377 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.997912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  31.68 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  30.45 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  30.48 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 		 404 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  27.99 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  29.81 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.53 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3836  extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.335848  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  29.11 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  28.34 
 
 		 378 aa  99.8  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.93 
 
 		 428 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4914  extracellular ligand-binding receptor  30.86 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 378 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.25 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 380 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.15 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.86 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  29.86 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.03 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.86 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.86 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  32.79 
 
 		 387 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.86 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  29.15 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.17 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.15 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  29.47 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  30.03 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4919  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 380 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 398 aa  92.8  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  30.98 
 
 		 383 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  28.21 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.78 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.21 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2678  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.43 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.26 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  30.86 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.88 
 
 		 377 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  30.86 
 
 		 383 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 384 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  32.13 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>