More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3836 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3836  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
410 aa  833    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.335848  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3551  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.29 
 
 
378 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
390 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.39 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  28.53 
 
 
391 aa  127  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 
379 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  34.36 
 
 
376 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.48 
 
 
391 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 
379 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
375 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  28.64 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
386 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.01 
 
 
379 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.07 
 
 
375 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.01 
 
 
379 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  31.01 
 
 
379 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  31.01 
 
 
379 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.58 
 
 
382 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  31.3 
 
 
382 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  31.01 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  31.01 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  31.01 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  30.59 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
379 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.59 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  31.36 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.01 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  27.19 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  31.38 
 
 
371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.39 
 
 
374 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 
390 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
419 aa  113  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1842  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
394 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  31.43 
 
 
377 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
373 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
371 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  29.86 
 
 
379 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
371 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
383 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  30.79 
 
 
371 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
382 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 
378 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 
388 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.12 
 
 
376 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 
383 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  28.31 
 
 
383 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
404 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
372 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 
384 aa  106  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.54 
 
 
399 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  30 
 
 
380 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 
404 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
381 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  31.35 
 
 
376 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  28.74 
 
 
373 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.3 
 
 
396 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 
375 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  28.45 
 
 
373 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  29.75 
 
 
397 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
381 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
386 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
402 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.44 
 
 
404 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
405 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
381 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
379 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
386 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
386 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2319  extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
371 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
382 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2480  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 
375 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143282  normal  0.0556416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
397 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  29.41 
 
 
377 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.79 
 
 
386 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  29.47 
 
 
393 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  28.57 
 
 
392 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3025  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
382 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
370 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
393 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  28.75 
 
 
376 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  27.95 
 
 
383 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  28.35 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 
370 aa  99.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.41 
 
 
385 aa  99.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3863  extracellular ligand-binding receptor  30.91 
 
 
366 aa  99.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  25.88 
 
 
394 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  27.35 
 
 
381 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>