More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2165 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2165  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 377 aa  762    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.997912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2504  Extracellular ligand-binding receptor  47.61 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3976  branched-chain amino acid ABC transporter  48.36 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  decreased coverage  0.0022891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3656  extracellular ligand-binding receptor  49.31 
 
 		 393 aa  332  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0197403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0264  extracellular ligand-binding receptor  48.86 
 
 		 391 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5971  Extracellular ligand-binding receptor  42.82 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4261  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.43 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4242  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000756343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  26.59 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3768  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000114958  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5695  Extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.348726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1023  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.97 
 
 		 373 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.116287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  27.05 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.36 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3017  extracellular ligand-binding receptor  27.54 
 
 		 382 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.01 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  27.52 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  27.52 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.52 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.66 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.52 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0050  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.3 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3886  Extracellular ligand-binding receptor  26.72 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  25.3 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  25.98 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 386 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  27.22 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  27.22 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  27.22 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  26.28 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.15 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.6 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  28.27 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.27 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.27 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.27 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.27 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4969  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.935688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  28.15 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  28.27 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 		 599 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.91 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 380 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 391 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 391 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3836  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.335848  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.51 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1045  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 378 aa  89.4  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.65 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.99 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5221  Extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.029602  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  25.85 
 
 		 400 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2945  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>