More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2915 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
440 aa  885    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  99.09 
 
 
440 aa  878    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  76.38 
 
 
433 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  65.12 
 
 
440 aa  498  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  60.05 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  61.89 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  45.22 
 
 
421 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  36.55 
 
 
394 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.29 
 
 
394 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
425 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
405 aa  156  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  32.8 
 
 
424 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  30.49 
 
 
420 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  31.88 
 
 
449 aa  152  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
415 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  30.26 
 
 
422 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  30.28 
 
 
442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  29.2 
 
 
414 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  29.56 
 
 
415 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  29.37 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
424 aa  134  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  30.33 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
412 aa  127  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 
439 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  30.63 
 
 
451 aa  124  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  28.24 
 
 
447 aa  117  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
410 aa  116  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  34.51 
 
 
375 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  27.67 
 
 
370 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.76 
 
 
446 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
450 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 
404 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
404 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 
402 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  29.7 
 
 
449 aa  107  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
373 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 
383 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.4 
 
 
404 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
384 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.53 
 
 
386 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
369 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  35.07 
 
 
444 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.17 
 
 
396 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
396 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.93 
 
 
399 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
435 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
370 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 
427 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  32.49 
 
 
419 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
398 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
374 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  36.45 
 
 
449 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.08 
 
 
397 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.99 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  28.1 
 
 
380 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 
394 aa  97.1  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  25.25 
 
 
376 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
373 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  27.57 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
386 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  26.65 
 
 
377 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.68 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  24.77 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  30.6 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
376 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 
386 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.93 
 
 
385 aa  94  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  31.1 
 
 
381 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
383 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 
386 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.06 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 
397 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
375 aa  93.2  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.06 
 
 
380 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>