More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0295 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
425 aa  854    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  37.73 
 
 
447 aa  240  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 
449 aa  239  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  37.23 
 
 
450 aa  238  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  38.69 
 
 
427 aa  233  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  36.91 
 
 
451 aa  229  7e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  37.67 
 
 
482 aa  225  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  37.6 
 
 
392 aa  212  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 
392 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  36.84 
 
 
463 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  33.76 
 
 
433 aa  199  7e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  31.78 
 
 
435 aa  187  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  31.25 
 
 
426 aa  187  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 
824 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 
397 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  31.19 
 
 
826 aa  145  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 
752 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2043  extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 
415 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000117628  normal  0.0195109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
374 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
401 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 
440 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  28.05 
 
 
421 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.93 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
373 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
441 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  25.72 
 
 
442 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  26.2 
 
 
404 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  27.61 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
380 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
391 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
391 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1830  Extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.290342  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  28.76 
 
 
440 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  27.33 
 
 
439 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.97 
 
 
404 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4471  extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  24.05 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  28.29 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.32 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.5 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.66 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  28 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  24.31 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28 
 
 
380 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.43 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
370 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.57 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  26.85 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
384 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  24.72 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
460 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
376 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  24.57 
 
 
388 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  25.33 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  25.46 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
381 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  27.2 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>