More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2207 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
426 aa  835    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  67.96 
 
 
412 aa  546  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  56.52 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  43.92 
 
 
449 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  43.23 
 
 
424 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  43.12 
 
 
426 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  37.11 
 
 
439 aa  206  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  36.83 
 
 
415 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  35.28 
 
 
414 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  31.85 
 
 
415 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44.59 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  31.87 
 
 
442 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  34.14 
 
 
437 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  34.96 
 
 
423 aa  147  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
404 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 
442 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  41.41 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  39.33 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  30.87 
 
 
425 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 
439 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  29.55 
 
 
440 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 
440 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  26.26 
 
 
397 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  28.03 
 
 
410 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  29.82 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  25.32 
 
 
421 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  31.27 
 
 
394 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.99 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
441 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
376 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  27.86 
 
 
395 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.69 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  30.58 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  28 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 
388 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.47 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1670  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00502897  hitchhiker  0.00000000193878 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  26.69 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  29.64 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.67 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.33 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.82 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  28.81 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  24.37 
 
 
741 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.86 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.46 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  23.85 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  22.73 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  31.74 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.78 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.3 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  25.37 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  24.53 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.18 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  28.17 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  24.15 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  25.07 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  36.91 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  24.78 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.57 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  22.42 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  26.04 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  23.66 
 
 
368 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  24.18 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.56 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.57 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.57 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>