More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0778 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0778  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
437 aa  862    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.964446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0893  Extracellular ligand-binding receptor  63.13 
 
 
423 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  34.67 
 
 
449 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  35.44 
 
 
424 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  33.17 
 
 
426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 
412 aa  166  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  32.97 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  34.03 
 
 
426 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  31.34 
 
 
414 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  31.81 
 
 
439 aa  149  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  31.11 
 
 
440 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 
440 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3207  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  34.4 
 
 
446 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  27.11 
 
 
421 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 
441 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1489  Legumain  29.11 
 
 
741 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  27.89 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  29.44 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  30.39 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 
372 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.04 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  37.91 
 
 
400 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  36.24 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  29.97 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  27.83 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0174  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.03 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19527  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  27.82 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  31.13 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3335  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  25.4 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  36.64 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  26.69 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0165  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.2 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.503783  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  26.97 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.77 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  28.77 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  25.94 
 
 
420 aa  67  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  29.96 
 
 
393 aa  67  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  35.88 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  32.62 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 
376 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 
384 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  26.8 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  26.23 
 
 
389 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 
417 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 
376 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
373 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  28.57 
 
 
391 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.49 
 
 
384 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.63 
 
 
374 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
368 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  30.53 
 
 
412 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
375 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  25.89 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  29.95 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  28.28 
 
 
395 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.57 
 
 
371 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  33.15 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 
384 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  28.43 
 
 
384 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  25.66 
 
 
439 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  31.8 
 
 
367 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  27.8 
 
 
401 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  28.5 
 
 
386 aa  60.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 
412 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3099  Extracellular ligand-binding receptor  30.96 
 
 
367 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 
394 aa  59.7  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 
374 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 
379 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  30.27 
 
 
400 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>