More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0291 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 401 aa  813    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  40.05 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.16 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  38.74 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  39.16 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  38.58 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  40.63 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  38.23 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  36.95 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  39.78 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  39.34 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  38.24 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  35.75 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  35.89 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  35.62 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  36.71 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  34.6 
 
 		 394 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  32.48 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  34 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  31.68 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  32.27 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  34.71 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  33.59 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  31.65 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.69 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  31.14 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  33.51 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  31.5 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  30.98 
 
 		 410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 		 381 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 379 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  30.06 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 379 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  28.28 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.37 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.5 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  27.05 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  27.13 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  29.87 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.72 
 
 		 380 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  26.53 
 
 		 384 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  27.17 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  26.42 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.44 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  25.87 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  25.75 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.16 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.44 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  26.02 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  26.84 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.14 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.07 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  29.27 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  26.46 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  26.63 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  25.14 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.06 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.25 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  26.63 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.19 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2830  Extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.345866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>