More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1762 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 449 aa  900    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  77.86 
 
 		 447 aa  632  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  78.39 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  74.48 
 
 		 451 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1701  extracellular ligand-binding receptor  45.41 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.58174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1587  extracellular ligand-binding receptor  43.95 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1775  extracellular ligand-binding receptor  48.1 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000602209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0504  extracellular ligand-binding receptor  46.25 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.273135 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0295  extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00215274  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 427 aa  207  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1503  extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.128913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0825  extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  32.72 
 
 		 397 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1805  extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0316  extracellular ligand-binding receptor  32.45 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2456  Extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0716  Extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 		 824 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  28.12 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2659  extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 		 752 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2615  extracellular ligand-binding receptor  27.98 
 
 		 373 aa  107  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  28.63 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  28.63 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  31.96 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0556  histidine kinase  24.16 
 
 		 826 aa  103  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.241536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2213  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.41 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0585  Extracellular ligand-binding receptor  24.27 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  29.26 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4334  Extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1925  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0315464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  26.83 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.42 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  26.95 
 
 		 384 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  26.42 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.17 
 
 		 380 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  26.21 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.42 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.94 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 381 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 380 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 386 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 380 aa  96.3  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.52 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.52 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  25.52 
 
 		 372 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 		 376 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  25.52 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.52 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.52 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  26.03 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.68 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3685  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.24 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  27.72 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  26.76 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3654  extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.18 
 
 		 378 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5665  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 380 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 393 aa  93.2  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2411  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 		 376 aa  93.2  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.32979  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 		 382 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6110  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.95 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  28.72 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.6 
 
 		 397 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  25.74 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.38 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  27.4 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.7 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2197  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 376 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  27.59 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5327  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  28.45 
 
 		 372 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>